谷歌攜手哈佛-MIT 博德研究所,將基因組分析工具帶到谷歌云平臺

谷歌今天宣布了它與 哈佛-麻省理工博德研究所 的合作,谷歌云平臺將推出該研究所的 基因組分析工具包 (GATK)的內部測試版,并將這一工具包作為一項服務提供給用戶。該軟件是由博德研究所開發,用來幫助科學家快速分析基因組測序數據的工具,它將免費提供給學術研究人員(不過他們還是要付費使用谷歌的云平臺服務)。商業用戶會需要從博德獲取許可證來使用該軟件。
這項服務會作為 谷歌基因組 的一部分來提供給用戶,后者是谷歌為生命科學研究推出的云計算平臺,也是一個相對不知名的谷歌云平臺部分。該平臺在 2014 年初 推出 ,但自推出以來動靜相對較小。
谷歌與博德的合作伙伴關系產生的第一個成果就是將 GATK 帶到谷歌云平臺。
DNA 測序會產生大量的數據(一個人未經處理的基因組數據大于 100G ),而博德研究所對超過 140 萬個生物樣本進行了基因組測序或分型。要分析所有這些數據需要龐大的資源,而這就是需要與谷歌進行合作的地方。除了提供計算平臺用于分析數據,谷歌還表示 GATK——在兩家合作關系之外,這一軟件已被許多科學家所使用——會給予研究者信心,他們是“根據最佳實踐來處理他們的數據,無需擔心 IT 基礎設施的管理問題。”
“博德和谷歌都有著協作和數據開放的文化,”谷歌基因組負責人大衛·格萊澤說道。“谷歌基因組幫助科學家讓基因組信息更容易獲取,實用性更大。我們希望通過在谷歌云平臺上提供博德的 GATK 服務加快這一偉大的科學進程。”
對于研究人員來說,能夠在云端使用這一工具包意味著他們無需擔心自己的 IT 基礎設施的設置問題,而這個問題往往會在實際研究和分析之外耗費許多時間和人力。
題圖來自: Dave Fayram / Flickr ,在 CC BY 2.0 協議下授權
翻譯:曹木
Google Partners With Broad Institute Of MIT And Harvard To Bring Genome Analysis Tool To Its Cloud Platform